Геном Staphylococcus epidermidis из казеозного некроза туберкулемы

Ряд факультативно-анаэробных липофильных микроорганизмов, включая представителей Corynebacterium и Staphylococcaceae, обитают в некротическом содержимом туберкулем. Проведено выделение из казеума штамма Staphylococcus epidermidis, его полногеномное секвенирование и картирование генов. Выявили, что коагулазонегативный стафилококк относится к генотипу MLST 73 и устойчив к двум противотуберкулезным препаратам. Фенотипически штамм обладает уреазной, желатиназной и бета-гемолитической активностью и имеет соответствующие гены. Как и у S. epidermidis O47, его геном состоит из одной хромосомы, содержащей около 2.4 млн пар нуклеотидов, а oriC имеет такую же ориентацию. Всего было идентифицировано 2333 гена, из которых 2206 были кодирующими. В контигах изученного генома обнаружены последовательности генов репликации плазмид: rep7a, rep13, rep5b и pSK1. Филогенетический анализ указывает на близость анализируемого генома с большой группой европейских штаммов. Учитывая биохимические и микробиологические свойства выделенного штамма, мы предполагаем, что стафилококки и другие факультативно-анаэробные микроорганизмы-сателлиты туберкулезных очагов могут играть важную роль в разжижении казеозного некроза за счет собственной протеолитической активности и привлечения нейтрофилов к очагу воспаления.