Отправить статью по E-mail 
Генетическое разнообразие пяти пород крупного рогатого скота по SNP-маркерам, ассоциированным с состоянием здоровья
- Авторы: Бытов М.В.1, Зубарева В.Д.1, Вольская С.В.1, Исаева А.Г.1, Нохрин Д.Ю.1, Осипова Ю.А.1, Соколова О.В.1
-
Учреждения:
- Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
- Выпуск: Том 60, № 6 (2024)
- Страницы: 55-61
- Раздел: ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ
- URL: https://rjpbr.com/0016-6758/article/view/667248
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675824060056
- EDN: https://elibrary.ru/BXVTWP
- ID: 667248
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Аннотация
Генетическое тестирование животных в настоящее время является важной составляющей в развитии агропромышленного комплекса. Совершенствование молекулярно-генетических технологий с каждым годом позволяет быстрее и дешевле проводить генетические исследования, направленные на поиск наиболее ценных особей крупного рогатого скота. Аборигенные породы крупного рогатого скота являются привлекательным объектом для таких исследований, поскольку обладают бо́льшим адаптационным потенциалом и устойчивостью к заболеваниям. Однако современные сравнительные данные о генетическом разнообразии большинства локальных пород по SNP-маркерам, ассоциированным со здоровьем, отсутствуют. Проведение ассоциативных генетических тестов по данным генетическим маркерам для тагильской, сычёвской, суксунской и истобенской пород еще предстоит. Цель данной работы − сравнение генетического разнообразия пяти пород крупного рогатого скота по SNP-маркерам, ассоциированным с развитием кетоза, мастита и продуктивным долголетием.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
М. В. Бытов
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
В. Д. Зубарева
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
С. В. Вольская
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
А. Г. Исаева
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
Д. Ю. Нохрин
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
Ю. А. Осипова
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
О. В. Соколова
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Автор, ответственный за переписку.
Email: nauka_sokolova@mail.ru
Россия, Екатеринбург, 620142
Список литературы
- Модоров М.В., Ткаченко И.В., Грин А.А. и др. Генетическая структура популяции голштинизированного черно-пестрого скота на территории Урала // Генетика. 2021. Т. 57. № 4. С. 437−444. https://doi.org/10.31857/S001667582104010X.
- Юдин Н.С., Ларкин Д.М.. Происхождение, селекция и адаптация российских пород крупного рогатого скота по данным полногеномных исследований // Вавиловский журн. генетики и селекции. 2019. Т. 23. № 5. С 559−568. https://doi.org/10.18699/VJ19.525
- Породы крупного рогатого скота: справочник / Сост. Иванова Н.В., Максимов А.Г. Перси-ановский: Донской ГАУ, 2019. 143 с. URL: https://e.lanbook.com/book/148559
- Фетисова Л.В. Создание и совершенствование сычевской породы крупного рогатого скота. Смоленск: Смоленское кн. изд-во, 1959. 163 с.
- The State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture / Eds Rischkowsky B., Pilling D. FAO, 2007. 524 с.
- Информационная система по разнообразию домашних животных (ИС-РДЖ). [Электронный ресурс] // URL: https://www.fao.org/dad-is/browse-by-country-and-species/ru/ (дата обращения: 10.11.2023).
- Столповский Ю.А., Бекетов С.В., Солоднева Е.В. и др. Генетическая структура аборигенного тагильского скота по STR- и SNP-маркерам // С.-х. биология. 2021. Т. 56. № 6. С. 1111−1122. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2021.6.1123rus.
- Nayeri S., Schenkel F., Fleming A. et al. Genome-wide association analysis for β-hydroxybutyrate concentration in Milk in Holstein dairy cattle // BMC Genetics. 2019. V. 20. № 58. P. 1−17. https://doi.org/10.1186/s12863-019-0761-9.
- Horst R.L., Goff J.P., Reinhardt T.A. Calcium and vitamin D metabolism during lactation // J. Mammary Gland Biol. Neoplasia. 1997. V. 2. P. 253–263. https://doi.org/10.1023/A:1026384421273.
- Nayeri S., Sargolzaei M., Abo-Ismail M.K. et al. Genome-wide association study for lactation persistency, female fertility, longevity, and lifetime profit index traits in Holstein dairy cattle // J. Dairy Science. 2017. V. 100. № 2. P. 1246−1258. https://doi.org/10.3168/jds.2016-11770
- Бытов М.В., Соколова О.В., Безбородова Н.А. и др. Методы генотипирования крупного рогатого скота для post-GWAS аннотирования SNPs // Аграрный вестник Урала. 2023. № 06 (235). С. 67‒75. https://doi.org/10.32417/1997-4868-2023-235-06-67-75
- Haberman S.J. The analysis of residuals in cross-classified tables // Biometrics. 1973. V. 29. № 1. P. 205−220. https://doi.org/10.2307/2529686
- 13. Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Paleontological Statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. 2001. V. 4. № 1. P. 1−9.
- Santos F.A.B., Lemes R.B., Otto P.A. HW_TEST, a program for comprehensive Hardy−Weinberg equilibrium testing // Genet. Mol. Biol. 2020. V. 43. № 2. https://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2019-0380
- Henschke H. De Finetti diagram. [Электронный ресурс] // URL: https://web.archive.org/web/20110719103301/https://finetti.meb.unibonn.de/downloads/finetti_3.0.5_windows.zip (дата обращения: 1.11.2023).
- Peakall R., Smouse P.E. Genalex 6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Notes. 2006. V. 6. № 1. P. 288−295. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x
- Tang D., Chen M., Huang X. et al. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing // PLoS One. 2023. V. 18. № 11. P. 1−8. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0294236
- Chen B., Cole J.W., Grond-Ginsbach C. Departure from Hardy−Weinberg equilibrium and genotyping error // Front. Genet. 2017. V. 8. № 167. P. 1−6. https://doi.org/10.3389/fgene.2017.00167
- Abramovs N., Brass A., Tassabehji M. Hardy−Weinberg equilibrium in the large scale genomic sequencing era // Front. Genet. 2020. V. 11. № 210. P. 1−11. https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00210
- Ye J., Coulouris G., Zaretskaya I. et al. Primer-BLAST: A tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction // BMC Bioinformatics. 2012. V. 13. № 134. P. 1−11. https://doi.org/10.1186/1471-2105-13-134
- Шевелёва О.М., Бахарев А.А., Терещенко И.Я. Экстерьерные особенности крупного рогатого скота мясных пород в условиях Северного Зауралья // Животноводство и кормопроизводство. 2023. Т. 106. № 3. С. 35-45.
- Зиновьева Н.А., Доцев А.В., Сермягин А.А. и др. Изучение генетического разнообразия и популяционной структуры российских пород крупного рогатого скота с использованием полногеномного анализа SNP // С.-х. биология. 2016. Т. 51. № 6. С. 788−800. https://doi.org/10.15389 agrobiology.2016.6.788rus
Дополнительные файлы
