Синтез и цитотоксическая активность производных 1,5,6,7-тетрагидроиндол-4-она и его тиоаналога

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Синтезированы производные 1,5,6,7-тетрагидроиндол-4-она и его тиоаналога. Изучена их цитотоксичность in vitro в отношении клеток HЕК293, Jurkat и MCF-7. Выявлено соединение-хит – 6,6-диметил-1-(2-метилфенил)-2-фенил-1,5,6,7-тетрагидро-4H-индол-4-он, ингибирующее метаболическую активность клеток лимфобластного лейкоза (Jurkat) c IC50 = 14.8 мкM и нормальных клеток эмбриональных клеток почки человека (НЕК293) с IC50 = 93.63 мкM. In silico показано, что механизм цитотоксического действия наиболее активного соединения, предположительно, может реализовываться за счет его взаимодействия с сайтом циклин-зависимой киназы CDK9.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Валерия Андреевна Сорокина

Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: tsypysheva.ip@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-5311-9580

Уфимский институт химии

Россия, Уфа

Дмитрий Олегович Цыпышев

Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Email: tsypysheva.ip@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4551-0226

Уфимский институт химии

Россия, Уфа

Алёна Витальевна Ковальская

Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Email: tsypysheva.ip@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7772-2894

Уфимский институт химии

Россия, Уфа

Венер Абсаттарович Вахитов

Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Email: tsypysheva.ip@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-8805-9872

Институт биохимии и генетики

Россия, Уфа

Инна Петровна Цыпышева

Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Email: tsypysheva.ip@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5025-8742

Уфимский институт химии

Россия, Уфа

Список литературы

  1. Gomtsyan A. // Chem. Heterocycl. Compd. 2012. Vol. 48. P. 7. doi: 10.1007/s10593-012-0960-z
  2. Sperry J.B., Wright D.L. // Curr. Opin. Drug. Discov. Devel. 2005. Vol. 8. P. 723
  3. Shiro T, Fukaya T, Tobe M. // Eur. J. Med. Chem. 2015. Vol. 97. P. 397. doi: 10.1016/j.ejmech.2014.12.004
  4. Huigens R.W. 3rd, Brummel B.R., Tenneti S., Garrison A.T., Xiao T. // Molecules. 2022. Vol. 27. P. 1112. doi: 10.3390/molecules27031112
  5. Raffa D. Maggio B., Raimondi M.V., Cascioferro S., Plescia F., Cancemi G., Daidone G. // Eur. J. Med. Chem. 2015. Vol. 97. P. 732. doi: 10.1016/j.ejmech.2014.12.023
  6. Afzal O., Kumar S., Haider M.R., Ali M.R., Kumar R., Jaggi M., Bawa S. // Eur. J. Med. Chem. 2015. Vol. 97. P. 871. doi: 10.1016/j.ejmech.2014.07.044
  7. Машковский М.Д. Лекарственные средства. М.: Новая волна, 2021. 1216 c.
  8. Almagro L., Fernández-Pérez F., Pedreño M.A. // Molecules. 2015. Vol. 20. P. 2973. doi: 10.3390/molecules20022973
  9. Fernández-Pérez F., Almagro L., Pedreño M.A., Gómez Ros L.V. // Pharm. Biol. 2013. Vol. 51. P. 304. doi: 10.3109/13880209.2012.722646
  10. Yu H., Jin H., Gong W., Wang Z., Liang H. // Molecules. 2013. Vol. 18. P. 1826. doi: 10.3390/molecules18021826
  11. Sachdeva H., Mathur J., Guleria A. // J. Chil. Chem. Soc. 2020. Vol. 65. P. 4900. doi: 10.4067/s0717-97072020000204900
  12. Sibel S. // Curr. Org. Chem. 2017. Vol. 21. P. 2068. doi: 10.2174/1385272821666170809143233
  13. Aggarwal B.B., Ichikawa H. // Cell Cycle. 2005. Vol. 4. P. 1201. doi: 10.4161/cc.4.9.1993
  14. Jia Y., Wen X., Gong Y., Wang X. // Eur. J. Med. Chem. 2020. Vol. 200. P. 112359. doi: 10.1016/j.ejmech.2020.112359
  15. Hong Y., Zhu Y.Y., He Q., Gu S.X. // Bioorg. Med. Chem. 2022. Vol. 55. P. 116597. doi: 10.1016/j.bmc.2021.116597
  16. Kaur B., Venugopal S., Verma A., Sahu S.K., Wadhwa P., Kumar D., Sharma A. // Curr. Org. Synth. 2023. Vol. 20. P. 376. doi: 10.2174/1570179419666220509215722
  17. Wan Y., Li Y., Yan C., Yan M., Tang Z. // Eur. J. Med. Chem. 2019. Vol. 183. P. 111691. doi: 10.1016/j.ejmech.2019.111691
  18. Asati V., Bhupal R., Bhattacharya S., Kaur K., Gupta G.D., Pathak A., Mahapatra D.K. // Anticancer Agents Med. Chem. 2023. Vol. 23. P. 404. doi 10.2174/ 1871520622666220607143040
  19. Badopra A.H. // J. Appl. Chem. 2018. Vol. 7. P. 299.
  20. Choi S.J., Lee J.E., Jeong S.Y., Im I., Lee S.D., Lee E.J., Lee S.K., Kwon S.M., Ahn S.G., Yoon J.H., Han S.Y., Kim J.I., Kim Y.C. // J. Med. Chem. 2010. Vol. 53. P. 3696. doi: 10.1021/jm100080z
  21. Jacquemard U., Dias N., Lansiaux A., Bailly C., Logé C., Robert J.M., Lozach O., Meijer L., Mérour J.Y., Routier S. // Bioorg. Med. Chem. 2008. Vol. 16. P. 4932. doi: 10.1016/j.bmc.2008.03.034
  22. Choi S.J., Lee J.E., Jeong S.Y., Im I., Lee S.D., Lee E.J., Lee S.K., Kwon S.M., Ahn S.G., Yoon J.H., Han S.Y., Kim J.I., Kim Y.C. // J. Med. Chem. 2010. Vol. 53. P. 3696. doi: 10.1021/jm100080z
  23. Martinez R., Avila-Zarraga G., Ramirez M.T., Perez A. // Arkivoc. 2003. N 11. P. 48. doi: 10.3998/ark.5550190.0004.b06
  24. Martínez R., Avila J.G., Ramírez M.T., Pérez A., Martínez A. // Bioorg. Med. Chem. 2006. Vol. 14. P. 4007. doi: 10.1016/j.bmc.2006.02.012
  25. Martínez R., Clara-Sosa A., Ramírez Apan M.T. // Bioorg. Med. Chem. 2007. Vol. 15. P. 3912. doi 10.1016/ j.bmc.2006.12.018
  26. Martínez R., Arzate M.M., Ramírez-Apan M.T. // Bioorg. Med. Chem. 2009. Vol. 17. P. 1849. doi 10.1016/ j.bmc.2009.01.056
  27. Сорокина В.А., Цыпышев Д.О., Ковальская А.В., Цыпышева И.П. // Вестн. Башкирск. унив. 2021. Т. 26. С. 304. doi: 10.33184/bulletin-bsu-2021.2.6
  28. RCSB Protein Data Bank. https://www.rcsb.org
  29. Schonbrunn E., Betzi S., Alam R., Martin M.P., Becker A., Han H., Francis R., Chakrasali R., Jakkaraj S., Kazi A., Sebti S.M., Cubitt C.L., Gebhard A.W., Hazlehurst L.A., Tash J.S., Georg G.I. // J. Med. Chem. 2013. Vol. 56. P. 3768. doi: 10.1021/jm301234k
  30. Ahn J.S., Radhakrishnan M.L., Mapelli M., Choi S., Tidor B., Cuny G.D., Musacchio A., Yeh L.A., Kosik K.S. // Chem. Biol. 2005. Vol. 12. P. 811. doi: 10.1016/j.chembiol.2005.05.011
  31. Bettayeb K., Baunbæk D., Delehouze C., Loaëc N., Hole A.J., Baumli S., Endicott J.A., Douc-Rasy S., Bénard J., Oumata N., Galons H., Meijer L. // Genes Cancer. 2010. Vol. 1. P. 369. doi: 10.1177/1947601910369817
  32. Положенцева И.А., Ковальская А.В., Цыпышев Д.О., Лобов А.Н., Назаров А.М., Данилко К.В., Катаев В.А. // Баш. хим. ж. 2018. Том 25. С. 59. doi: 10.17122/bcj-2018-1-59-66
  33. Ramadas S.R., Padmanabhan S. // J. Prakt. Chem. 1978. Vol. 320. P. 863. doi: 10.1002/prac.19783200520
  34. Khalafy J., Badparvar F., Marjani A.P. // J. Chil. Chem. Soc. 2016. Vol. 61. P. 3112. doi: 10.4067/s0717-97072016000300021
  35. Koval’skaya A.V., Petrova P.R., Tsypyshev D.O., Lobov A.N., Tsypysheva I.P. // Nat. Prod. Res. 2022. Vol. 36. P. 3538. doi: 10.1080/14786419.2020.1868460
  36. Schrödinger Release 2018-1: Maestro, Schrödinger, LLC, New York, 2018 (демо-версия от 03.03.2021 для ФГБУ «Институт фармакологии им. А.В. Закусова», Москва)
  37. Harder E., Damm W., Maple J., Wu C., Reboul M., Xiang J.Y., Wang L., Lupyan D., Dahlgren M.K., Knight J.L., Kaus J.W., Cerutti D.S., Krilov G., Jorgensen W.L., Abel R., Friesner R.A. // J. Chem. Theory. Comput. 2016. Vol. 12. P. 281. doi: 10.1021/acs.jctc.5b00864
  38. Sastry G.M., Adzhigirey M., Day T., Annabhimoju R., Sherman W. // J. Comput. Aided Mol. Des. 2013. Vol. 27. P. 221. doi: 10.1007/s10822-013-9644-8
  39. Jacobson M.P., Pincus D.L., Rapp C.S., Day T.J., Honig B., Shaw D.E., Friesner R.A. // Proteins. 2004. Vol. 55. P. 351. doi: 10.1002/prot.10613
  40. Jacobson M.P., Friesner R.A., Xiang Z., Honig B. // J. Mol. Biol. 2002. Vol. 320. P. 597. doi: 10.1016/s0022-2836(02)00470-9
  41. Friesner R.A., Murphy R.B., Repasky M.P., Frye L.L., Greenwood J.R., Halgren T.A., Sanschagrin P.C., Mainz D.T. // J. Med. Chem. 2006. Vol. 49. P. 6177. doi: 10.1021/jm051256o
  42. Halgren T.A., Murphy R.B., Friesner R.A., Beard H.S., Frye L.L., Pollard W.T., Banks J.L. // J. Med. Chem. 2004. Vol. 47. P. 1750. doi: 10.1021/jm030644s
  43. Friesner R.A., Banks J.L., Murphy R.B., Halgren T.A., Klicic J.J., Mainz D.T., Repasky M.P., Knoll E.H., Shelley M., Perry J.K., Shaw D.E., Francis P., Shenkin P.S. // J. Med. Chem. 2004. Vol. 47. P. 1739. doi: 10.1021/jm0306430

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Оценка влияния соединения 3 на прогрессию клеточного цикла клеток HEK293, MCF-7, и Jurkat. Клетки с тестируемым соединением в концентрации IC50, определенной для каждой клеточной линии, инкубировали в течение 24 (а), 48 (б), 72 ч (в). Данные, полученные в двух независимых экспериментах (N = 2, n = 6), представлены в виде среднего значения ± стандартное отклонение; * – р < 0.05 (t-критерий Уилкоксона).

Скачать (346KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Докинг-позы производного 3 (а) и референсного лиганда S-CR8 (б) в 3LQ5 сайте связывания CDK9; водородные связи обозначены пунктирными линиями.

Скачать (392KB)
Метаданные
4. Схема 1.

Скачать (129KB)
Метаданные
5. Схема 2.

Скачать (128KB)
Метаданные
6. Схема 3.

Скачать (51KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024